ΕΥΡΩΠΑΪΚΑ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΑ
Στα πλαίσια της προσπάθειας ενίσχυσης των διακρατικών σχέσεων ο Οργανισμός συμμετέχει σε μια σειρά προγραμμάτων της κοινοτικής πρωτοβουλίας INTERREG τόσο στη δράση INTERREG IΙIA Ελλάδα – Ιταλία όσο και στη δράση INTERREG IΙIB ARCHIMED. Τα εν λόγω προγράμματα εστιάζονται στην προώθηση της συνδυασμένης μεταφοράς, την αύξηση της δυνατότητας πρόσβασης και της σύνδεσης των κρίσιμων περιοχών του θαλάσσιου χώρου της Μεσογείου και κυρίως της σύνδεσης με λιμάνια της Ιταλίας. Στοχεύουν κυρίως στην βελτιστοποίηση της υπάρχουσας μεταφοράς επιβατών και αγαθών, στη δημιουργία ενός κοινού συνόλου διαδικασιών, καθώς και στη γενικότερη προώθηση τουριστικών ρευμάτων μεταξύ των ενδιαφερομένων περιοχών.
Επίσης ο Οργανισμός Λιμένος έχει αναλάβει την διενέργεια των διαγωνισμών και συμμετέχει στην επιτροπή παρακολούθησης του έργου στο διακρατικό πρόγραμμα «Στρατηγικός Σχεδιασμός Ανάπτυξης Θαλασσίων Διαδρόμων στην Ανατολική Μεσόγειο» στο οποίο συμμετέχουν η Αρχή Λιμένων Μάλτας, το Υπουργείο Μεταφορών της Σλοβενίας, το Υπουργείο Υποδομών και Μεταφορών της Ιταλίας και η Αρχή Λιμένων Κύπρου, προϋπολογισμού για την Ελλάδα 1.775.000€.